​​המטה פועל מאמצע שנת 2009 כמטה משותף של שני משרדים - משרד התרבות והספורט ומשרד המדע והטכנולוגיה. מטה המשרד פועל לפיתוח ולטיפוח ההון האנושי במשרד, לשיפור סביבת העבודה, לקידום תרבות האיכות בעבודת המשרד באמצעות הטמעת ערכי התייעלות ואיכות בקרב העובדים.
במהלך שנת 2010 בוצעו מספר מהלכים מרכזיים שנועדו לשפר את האפקטיביות והיעילות בעבודת המשרד שהמרכזיים בהם הינם מהלך רחב של הטמעת תהליכי תכנון, מדידה ובקרה, כתיבה ועדכון של נהלי העבודה המשרדיים שיפור המערך המחשוב ועוד